La première partie du métro, qui a remplacé un itinéraire de tramway très fréquenté, a suivi Yonge Street d'Eglinton Avenue vers le sud jusqu'à Front Street, puis a tourné vers l'ouest pendant un pâté de maisons pour se terminer à Bay Street, à côté de la principale gare ferroviaire de la ville, Union Station, d'où le nom de la station de métro. Cette ligne a été achevée en 1954 et mesurait 7,4 km de long.
En 1963, une autre partie a été ajoutée, qui allait vers le nord à partir de la gare Union, en dessous de l'avenue University et de Queen's Park jusqu'à proximité de la rue Bloor, où elle tournait vers l'ouest pour se terminer à l'angle des rues St George et Bloor.
La ligne Bloor-Danforth a été ouverte en 1966 le long de la rue Bloor et de l'avenue Danforth, de Keele Street à Woodbine Avenue, et a été allongée en 1968 pour aller de Islington Avenue à la station Warden de l'avenue Warden et de l'avenue St.
Le tracé de la ligne à travers la vallée du Don a été possible grâce à un choix fait plus de quarante ans auparavant. Lorsque le viaduc Prince Edward a été construit à travers la rivière Don en 1919, sa conception comprenait deux ponts sous la route pour permettre la construction de futures lignes ferroviaires. Cela a permis au métro de traverser la vallée du Don jusqu'à l'avenue Danforth sur le côté est.
La ligne Yonge-Université a été prolongée au nord de 8,7 km d'Eglinton Avenue à Finch Avenue et Yonge en 1973 et 1974.
D'autres voies (9,9 km) ont été ajoutées à la ligne Yonge-University en 1978 lorsqu'elle a été prolongée de St. George et Bloor, au nord et au nord-ouest jusqu'à Eglinton Avenue et Allen Road, puis au nord le long du milieu d'Allen Road jusqu'à Wilson Avenue.
En octobre 1976, un incendie volontaire a détruit des wagons de métro et endommagé la station Christie. Cela a entraîné la fermeture de la ligne Bloor-Danforth pendant trois jours et la fermeture de la station Christie pendant un certain temps pour réparation. En 1980, des voies supplémentaires ont été ajoutées aux deux extrémités de la ligne Bloor-Danforth. Ces extensions ont chacune ajouté une station, des baies pour les bus et, à l'extrémité est, de la place pour se connecter à la RT de Scarborough.
Avec six stations sur 6,8 km de voies, la RT de Scarborough est une ligne construite presque entièrement en surface, et qui ne possède pas de voies directes qui se connectent aux autres lignes et utilise un train différent. Elle utilise les trains du système de transit de capacité intermédiaire (ICTS), qui sont très différents des rames de métro. La ligne est totalement séparée de la circulation routière et des piétons, les stations sont entièrement couvertes et les trains ont de nombreuses portes qui utilisent des quais élevés.
1,6 km supplémentaires ont été ajoutés à l'extrémité nord de la partie Spadina de la ligne Yonge-Université-Spadina, ajoutant une station (Downsview), avec un parking pour les bus.
En août 1995, le TTC a eu un très grave accident de métro dans ce qu'il appelle l'accident de Russell Hill, sur la ligne Yonge-University-Spadina au sud de la station St. Clair West. Clair West. Trois femmes sont mortes et 100 personnes ont été blessées, dont quelques unes gravement.
La toute dernière ligne de métro, Sheppard, a été inaugurée en 2002. Elle s'étend sur 5,5 km vers l'est, sous l'avenue Sheppard, de la station Sheppard de la ligne Yonge (aujourd'hui appelée Sheppard-Yonge), jusqu'à la station Don Mills, à l'angle de Sheppard et de Don Mills Road. La ligne Sheppard compte moins d'usagers que les deux autres lignes de métro, et des trains plus courts y circulent.
En plus de cinquante ans d'histoire, le premier bébé né sur le quai d'une station de métro TTC n'est né que récemment, le 6 février 2006. Cet incident s'est produit à la station Wellesley et a provoqué des retards dans le métro. Il a fait la une des journaux pendant de nombreux jours.
Un système vocal automatique a été ajouté pour annoncer chaque gare (par exemple : "La prochaine gare est Bloor, gare de Bloor"), ce qui a mis fin à la nécessité pour l'opérateur du train d'annoncer chaque arrêt. Le système automatisé est utilisé dans l'ensemble du métro et du système de RT.
